（一）水蛭素的物理性质
水蛭素为白色或灰白色的粉末，呈水溶性，脂溶性差，极易溶于水和生理盐水，难溶于乙醚等有机溶剂。
（二）稳定性
1，对文物和酸碱性环境的稳定性
水蛭素在温度变化和酸性环境条件下都异常稳定，单纯的温度升高到100℃或PH=1时都不改变结构，不影响其活性，只有在碱性条件下加热才能失活。在PH=13、温度在80℃时加热15分钟才失去活性。在体内，水蛭素可抗胰蛋白酶水解，经胃蛋白酶和糜蛋白酶消化后，N端核心区违背破坏，依然有很高的抗凝活性，使天然水蛭素可成为一种口服药。
2，对周围环境的稳定性
水蛭素度湿度较为敏感，当期湿度在10%以下时非常稳定，只有湿度在10%以上时，随湿度上升，其稳定时间逐步缩短，因此，要将含有天然水蛭素的产品置于密封、干燥、通风的条件下保存，以防因潮湿而失效。
3，对辐射的稳定性
水蛭素粉（含水量10%以下时）对辐射不太敏感，当辐射剂量在10千戈瑞（KGy）(食物正常消毒时的安全辐射剂量为4~6KGy）时，对其活性五影响，可见用辐射消毒水蛭素粉是有效、安全的。
水蛭素水溶液对辐射较为敏感，当辐射剂量为4KGy时，其活性全部丧失，因此水蛭素水溶液不宜采用辐射消毒。
（三）水蛭素的计算单位
天然水蛭素的计算单位为国际单位。即在37℃的环境条件下，中和一个凝血酶单位所需的水蛭素量称为一个国际单位，简写为AT-U。
